Čerpání ze strukturálních fondů EU
Úřad pro ochranu hospodářské soutěže využívá finančních prostředků čerpaných ze Strukturálních fondů Evropské unie na zkvalitnění služeb poskytovaných veřejnosti, a to jak prostřednictvím vylepšování a modernizace technických prostředků, tak lepším nastavením řízení procesů a zkvalitňováním lidských zdrojů. Z Evropského sociálního fondu – Operačního programu lidské zdroje a zaměstnanost a z Integrovaného operačního programu Úřad v současné době financuje tři projekty, další jsou v přípravě.
Evropský sociální fond - Operační program Lidské zdroje a zaměstnanost 
Operační program Lidské zdroje a zaměstnanost je zaměřený na snižování nezaměstnanosti prostřednictvím aktivní politiky na trhu práce, profesního vzdělávání, dále na začleňování sociálně vyloučených obyvatel zpět do společnosti, zvyšování kvality veřejné správy a mezinárodní spolupráci v uvedených oblastech. Z fondů EU je pro OP LZZ vyčleněno celkem 1,84 mld. €, což činí přibližně 6,80 % veškerých prostředků určených z fondů EU pro Českou republiku. Z českých veřejných zdrojů má být navíc financování programu navýšeno o dalších 0,32 mld. €. Řídícím orgánem ESF – OP LZZ je Ministerstvo práce a sociálních věcí ČR.
ÚOHS v rámci OP LZZ realizuje následující projekty:
- Zefektivnění řízení procesů na ÚOHS
- Nastavení systému strategického řízení a plánování, včetně zpracování strategie řízení a rozvoje lidských zdrojů
- Zavedení efektivního systému řízení a rozvoje lidských zdrojů ÚOHS
- Osvěta a transparentnost veřejných zadavatelů
- Nastavení systému bezpečnosti informací a komunikace na ÚOHS
Integrovaný operační program
Integrovaný operační program (IOP) je zaměřený na řešení společných regionálních problémů v oblastech infrastruktury pro veřejnou správu, veřejné služby a územní rozvoj: rozvoj informačních technologií ve veřejné správě, zlepšování infrastruktury pro oblast sociálních služeb, veřejného zdraví, služeb zaměstnanosti a služeb v oblasti bezpečnosti, prevence a řešení rizik, podporu cestovního ruchu, kulturního dědictví, zlepšování prostředí na sídlištích a rozvoj systémů tvorby územních politik. Řídícím orgánem IOP je Ministerstvo pro místní rozvoj ČR.
V rámci IOP ÚOHS realizuje projekt:
- Úprava elektronické spisové služby a IT podpora správních řízení na ÚOHS